企业所得税扣除项目有按规定标准扣除的，剩下的是据实扣除的。分别如下：
1、工资、薪金支出：企业发生的合理的工资薪金支出准予据实扣除
2、职工培训费：第7节我们知道集成电路和软件企业的职工培训费可全额扣除。这里的全额扣除是准确划分的，如不能准确划分仍按工资薪金总额的2%计算扣除限额
3、企业上交的工会经费：从2010年1月1日起，在委托税务机关代收工会经费的地区，企业上交的工会经费，可凭合法、有效的工会经费代收凭据依法在税前扣除
4、环境保护专项资金：企业按规定提取的用于环保、生态恢复等方面的专项资金，准予扣除。如专项资金改变用途的，不得扣除
5、劳动保护费：企业发生的合理的劳动保护支出，准予扣除
6、总机构分摊的费用：非居民企业在中国境内设置的机构场所，就其中国境外总机构发生的与境内机构场所生产经营有关的费用，如能提供总机构出具的费用汇集范围、定额、分配依据及方法等证明文件，并能合理分摊的，准予扣除
7、手续费及佣金支出：从事代理服务、主营业务收入为手续费、佣金的企业（比如证券、保险代理、期货等企业），其为取得该类收入而实际发生的营业成本（包括手续费及佣金支出），准予在企业所得税前据实扣除
需要补充的是：
1、企业如雇用季节工、临时工、实习生、返聘离退休人员及接受劳务派遣人员所实际发生的费用，应区分为工资薪金支出和职工福利费支出，按规定在税前扣除。属于工资薪金支出的，计入工资薪金支出 的总额，作为计算其他有关费用的扣除依据。
2、企业发行债券、贷款或吸收保户资金等方式融资发生的合理的费用，如符合资本化条件，应计入相关成本，不符合的，作为财务费用在税前列支
3、如企业发现以前年度实际发生了，按规定可在税前扣除而没有或少扣除的，企业在专项申报及说明后，税务机关应准予追补至该项目发生年度计算扣除，但追补年限不得超过5年。企业因此多交的税款，可在追补确认年度应纳税款中抵扣，不足抵扣的，可向以后年度递延或申请退税
4、亏损企业追补确认以前年度未在企业所得税前扣除的支出，或盈利企业经过追补后出现了亏损，应首先调整该支出所属年度的亏损额，然后再按照弥补亏损的原则计算以后年度多交的企业所得税款，按前述第3条规定处理
5、上市公司建立的职工股权激励计划的处理：
a、股权激励计划实行后立即可以行权：上市公司可根据实际行权时该股票的公允价格与激励对象实际行权支付价格的差额和数量，计算确定为当年上市公司的工资薪金支出，依照税法规定进行税前扣除
b、股权激励计划实行后需要一定等待期后方可行权：上市公司等待期内会计上计算确认的相关成本费用，不得在对应年度计算缴纳企业所得税时扣除。在股权激励计划可行权后，上市公司方可根据该股票实际行权时的公允价格与当年激励对象实际行权支付价格的差额及数量，计算确定作为当年上市公司工资薪金支出，依法税前扣除